SD Negeri Bangunrejo 1 ini terletak di Bangunrejo Tr I/1589, Kricak, Kecamatan Tegalrejo, Kota Yogyakarta, DIY.
Di posisi ke-tiga ada SD Negeri Bangunrejo 1 dengan indeks sekolah yakni 77,74.
4. SD Negeri Mendungan 2
SD Negeri Mendungan 2 ini terletak di Jl. Singoranu, Giwangan, Kec. Umbulharjo, Kota Yogyakarta, DIY.
Sekolah ini menduduki posisi ke-empat Sekolah Dasar Negeri terbaik di Yogyakarta dengan indeks sekolah yakni 77,35.
5. SD Negeri Serayu
Baca Juga: 10 Daftar Sekolah Dasar Negeri Terbaik di Jawa Barat, Ada Sekolahmu?
SD Negeri Serayu ini terletak di Jl. Juadi No.2, Kotabaru, Kecamatan Gondokusuman, Kota Yogyakarta, DIY.
Di posisi ke-lima ada SD Negeri Serayu dengan indeks sekolah sebesar 76,84.
6. SD Negeri Tegalrejo 1
SD Negeri Tegalrejo 1 ini beralamat di Jl. Bener No. 40, Bener, Kecamatan Tegalrejo, Kota Yogyakarta, DIY.
Sekolah ini menduduki peringkat ke-enam Sekolah Dasar Negeri terbaik di Yogyakarta dengan indeks sekolah yakni 76,34.