Begitu jernihnya air danau ini, banyak penumpang kapal yang melintas di Danau Baikal merasa ketakutan, terutama yang takut ketinggian atau kedalaman, karena mereka dapat melihat dengan jelas ke dalam danau hingga kedalaman 50 meter!
Air danau ini bersih dan jernih karena di sana banyak Epischura baikalensis, yaitu krustasea yang sangat kecil. Binatang itu menyaring lumut dan bakteri. Lumut dan bakteri adalah penyebab danau-danau jadi keruh airnya.
Selain itu, di sana banyak sekali udang sungai yang memakan sisa-sisa organik yang bisa membusuk.
Baca juga: Danau Loktak dan Cincin-cincin Raksasa
Binatang dan Tumbuhan Endemi Danau Baikal
Di Danau Baikal hidup ribuan jenis binatang dan tumbuhan. Beberapa di antaranya endemik Danau Baikal. Artinya, binatang atau tumbuhan itu hanya hidup di Danau Baikal.
Salah satu binatang endemik Baikal yang terkenal adalah nerpa. Nerpa adalah anjing laut Baikal.
Nerpa adalah salah satu dari hanya 3 jenis anjing laut di dunia yang hidup di air tawar.
Sesuai namanya, Epischura baikalensis, juga merupakan krustasea endemik Danau Baikal.
Selain itu di Danau Baikal hidup ikan omul. Ikan yang bentuk dan warnanya mirip ikan bandeng ini, paling dicari nelayan karena enak rasanya dan disukai orang sekitar danau. Biasanya ikan omul dijual setelah diasap.